Jurusan dan Program Keahlian di SMAS KRISTEN 2 SOE
Program jurusan IPA (Ilmu Pengetahuan Alam) dengan fokus pada mata pelajaran Matematika, Fisika, Kimia, dan Biologi.
Program jurusan IPS (Ilmu Pengetahuan Sosial) dengan fokus pada mata pelajaran Ekonomi, Sosiologi, Geografi, dan Sejarah.